顺带的，白皇后还说了说现实世界的情况。随着开膛手宁说出那句“我想要活下去，让流在我身体里的罪恶之血，乘着诺亚方舟流传到下个世纪”，现实世界中的工藤优作道出了托马斯·辛德勒杀害坚村忠彬的动机，那就是他作为计算机行业的巨头，竟然是开膛手杰克的后代。

先前泽田弘树在测试dna探查程序时，就从开膛手杰克用来杀人的短剑上提取到了哈妮·查理斯特的基因，和托马斯·辛德勒的基因进行交叉对比后，发现了他们其中的血缘关系，而那柄短剑又是辛德勒家的传家宝，如此一来，泽田弘树就发现了托马斯·辛德勒的身世。在这样的压力下，他知道一旦他完成诺亚方舟，托马斯·辛德勒也会杀了他的，于是在诺亚方舟完成的那天，他自己选择了自杀，但是在那之前将他的意识转入到了诺亚方舟内，并将诺亚方舟释放了出去。

而伴随着现实中托马斯·辛德勒承认他的罪行，游戏也宣告了终结。柯南和扮成诸星登志夫的诺亚方舟活了下来，柯南也认出了他就是诺亚方舟，末了还说：“虽然你让我们遭遇了各种危险，但其实你是相信我们一定会团结一致，克服所有危机的。所谓的让日本重生，并不是指抹杀第二三代的子孙，而是要让他们不依赖父母的力量克服障碍，通过游戏成长。”

诺亚方舟还是掉了金豆豆，他只是想和朋友们一起玩一次而已。“好了，你该回到你的世界去了。”

“工藤新一。”

柯南愣了愣，没多问什么，就走出了游戏通道，回到了现实世界。

诺亚方舟被留下了原地，他抹了抹眼泪，下一刻就会一个人环住了肩膀，她还说着特别恶劣的话：“啧啧，真是难看啊，诺亚方舟小弟弟。”

诺亚方舟涨红了脸：“你！”

他旋即恼羞成怒道：“你不怕我揭穿你的真面目吗，橘真夜。”

林宁想了想说：“那我就去揭穿江户川柯南的真面目。”

诺亚方舟跳起了脚：“你卑鄙！”

林宁笑得恶劣：“那卑鄙的我有个提议，你要不要听一听？”